По каким протоколам и с каким уровнем защиты/шифрования происходит обмен токенами при регистрации устройств?

Устройства могут регистрироваться с помощью доменных учётных записей или одноразовых кодов приглашения.
Взаимодействие устройств с сервером осуществляется по HTTPS. Устройства Android также подключаются к серверу по TLS. Внутри реализован проприетарный протокол поверх TCP.